Вычисление локальных тензоров деформации на основе относительного движения соседних частиц сольватированного 5-мерного пептида

Авторы

  • Андрей Сергеевич Кочкин ФГБОУ ВО «Алтайский государственный технический университет»
  • Кирилл Андреевич Теников
  • Михаил Дмитриевич Старостенков
  • Анастасия Юрьевна Варавина

DOI:

https://doi.org/10.54708/26587572_2023_511157

Ключевые слова:

Пептид, тензор, пакет OVITO, пакет LAMMPS, компьютерное моделирование

Аннотация

В настоящей научно-исследовательской работе был рассмотрен пептид, а именно было рассмотрено соотношение точек объемной деформации от деформации сдвига и исследована зависимость выходного тензора деформации от выходного тензора растяжения. В данной работебыла смоделирована деформация в 2000 шагов пептида с вычислением объемной деформацииот деформации сдвига и исследовано вычисление локальных тензоров. Более углубленно рассматривался 1466 за моделированный шаг, так как именно при исследовании на этом за моделированном шаге проявили частицы и частицы «соседи» пептида максимальный пик активности. В статье рассматривались два программных пакета. Свободно распространяемый пакетLAMMPS для выполнения на мультипроцессорных вычислительных системах моделирование систем, реализующий в своей основе метод молекулярной динамики, и в котором былосформировано и реализовано поведение частиц сольватированного 5-мерного пептида. И свободно распространяемый, второй программный пакет OVITO, который применялся для визуализации и распознавания деформации пептида. А именно пакет OVITO позволил распознатьи рассчитать в моделируемой атомной системе экспериментальные данные, которые отраженыв данной научной работе.

Загрузки

Опубликован

2023-26-05

Как цитировать

Кочкин, А. С., Теников, К. А. ., Старостенков, М. Д. ., & Варавина, А. Ю. . (2023). Вычисление локальных тензоров деформации на основе относительного движения соседних частиц сольватированного 5-мерного пептида. Materials. Technologies. Design, 5(1 (11), 57–63. https://doi.org/10.54708/26587572_2023_511157